数理生物学演習 2018年度

最終課題（提出期限：2018年8月10日（金））

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お知らせ

特になし．

場所

W1-C-202

連絡先

担当教員

  • 野下 浩司 noshita[at]morphometrics.jp

TA

  • 岩波 翔也 iwanamishoya[at]gmail.com
  • 原 朱音 hara.akane32a[at]gmail.com
  • 北川 耕咲 sack7844[at]gmail.com
  • 堀田 淳之介 j.horita.662[at]s.kyushu-u.ac.jp
  • 高木 舜晟 crystal.hk.039[at]gmail.com

内容

  1. Hello, World!
    • プログラミングの意義，プログラムが動くまで
    • 環境導入
  2. 個体群動態：離散
    • 離散ロジスティックモデル
    • 四則演算，繰り返し処理，ファイル入出力，結果の出力
    • ニュートン法
  3. 個体群動態：連続
    • 指数増殖，ロジスティック成長，最終課題へのロードマップ説明
    • 条件分岐，数値計算と数式処理
    • オイラー法
  4. 個体群動態：2種あるいは多種系
    • ロトカ・ボルテラ モデル，サーカディアンリズム，最終課題への
    • 結果の可視化
  5. 突然変異固定までの待ち時間
    • 確率過程
    • 擬似乱数
  6. 疫学モデル
    • SIRモデル
    • 数値積分，関数
    • 最小二乗法, Box-Muller法
  7. 理論形態学
    • Raupモデル，成長管モデル
    • 3Dパラメータ表示
  8. 研究をはじめるために
    • 文献検索，引用の仕方
    • Google Scholor，Web of Science
  9. 人工生命
    • セル・オートマトン，ライフゲーム
    • 時間変化する結果の可視化，境界条件
  10. 中間発表
    • 各人，各チームのプレゼン
  11. パターン形成
    • フレンチフラッグモデル，反応拡散系
    • ２次元配列
  12. 応用例紹介：？？？
  13. 応用例紹介：？？？
  14. 数理生物学でのプログラミング
    • まとめ，最終課題へ向けた調整